El más importante es el río Ebro. Durante su recorrido por nuestra comunidad recibe en su ribera derecha las aguas de otros ríos riojanos que hacen que aumente su caudal. Estos afluentes son de corto recorrido debido a la proximidad existente entre el Sistema Ibérico, lugar de su nacimiento, y el Ebro, lugar donde desembocan. Son de caudal irregular y sufren un fuerte estiaje.

Los afluentes más importantes del Ebro son: El Tirón y Oja, que se unen antes de desembocar en el Ebro, el Najerilla, el más largo y caudaloso de los afluentes riojanos, el Iregua, el Leza, el Cidacos y el Alhama.